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Análise de tripletos e de repetições em estruturas primárias de DNA

dc.contributor.authorLousado, José
dc.date.accessioned2012-04-10T13:33:29Z
dc.date.available2012-04-10T13:33:29Z
dc.date.issued2011-04-11
dc.description.abstractO desenvolvimento de equipamentos de descodificação massiva de genomas veio aumentar de uma forma brutal os dados disponíveis. No entanto, para desvendarmos informação relevante a partir da análise desses dados é necessário software cada vez mais específico, orientado para determinadas tarefas que auxiliem o investigador a obter conclusões o mais rápido possível. É nesse campo que a bioinformática surge, como aliado fundamental da biologia, uma vez que tira partido de métodos e infra-estruturas computacionais para desenvolver algoritmos e aplicações informáticas. Por outro lado, na maior parte das vezes, face a novas questões biológicas é necessário responder com novas soluções específicas, pelo que o desenvolvimento de aplicações se torna um desafio permanente para os engenheiros de software. Foi nesse contexto que surgiram os principais objectivos deste trabalho, centrados na análise de tripletos e de repetições em estruturas primárias de DNA. Para esse efeito, foram propostos novos métodos e novos algoritmos que permitirem o processamento e a obtenção de resultados sobre grandes volumes de dados. Ao nível da análise de tripletos de codões e de aminoácidos foi proposto um sistema concebido para duas vertentes: por um lado o processamento dos dados, por outro a disponibilização na Web dos dados processados, através de um mecanismo visual de composição de consultas. Relativamente à análise de repetições, foi proposto e desenvolvido um sistema para identificar padrões de nucleótidos e aminoácidos repetidos em sequências específicas, com particular aplicação em genes ortólogos. As soluções propostas foram posteriormente validadas através de casos de estudo que atestam a mais-valia do trabalho desenvolvido.por
dc.identifier.tid101230443
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/10400.19/1042
dc.language.isoporpor
dc.subjectBioinformáticapor
dc.subjectSistemas de informaçãopor
dc.subjectestruturas primárias de DNApor
dc.subjectanálise de tripletospor
dc.titleAnálise de tripletos e de repetições em estruturas primárias de DNApor
dc.typedoctoral thesis
dspace.entity.typePublication
oaire.citation.conferencePlaceUniversidade de Aveiropor
rcaap.rightsrestrictedAccesspor
rcaap.typedoctoralThesispor

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