Departamento de Zootecnia, Engenharia Rural e Veterinária (DZERV)
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Percorrer Departamento de Zootecnia, Engenharia Rural e Veterinária (DZERV) por Domínios Científicos e Tecnológicos (FOS) "Ciências Agrárias"
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- Avaliação do bem-estar em cães alojados no Santuário Animal Vida Boa: aplicação do Shelter Quality ProtocolPublication . Santos, João Rodrigues dos; Coelho, Catarina; Mega, Ana CristinaO bem-estar animal tem sido amplamente reconhecido como um indicador fundamental da qualidade dos sistemas de alojamento, particularmente em contextos de abrigo onde os animais se encontram em situação de vulnerabilidade. Para entender as condições de bem-estar dos cães alojados no Santuário Animal Vida Boa, em Vila Real aplicou-se o Shelter Quality Protocol, enquadrado nos princípios do Welfare Quality®. A avaliação baseada neste protocolo incide sobre indicadores ao nível do santuário, da box e do indivíduo, tendo sido avaliadas 30 boxes e 40 cães. Como complemento foi realizada uma análise SWOT, com o objetivo de identificar fatores internos e externos com potencial influência no bem-estar animal. De forma global, os resultados evidenciaram condições favoráveis ao bem-estar, com disponibilidade de água limpa, cama ou abrigo, proteção climática e baixa frequência de sinais clínicos e comportamentos repetitivos. No que diz respeito à avaliação individual, destacou-se a predominância de condição corporal adequada, pelagem limpa, ausência de alterações cutâneas e respostas maioritariamente sociáveis, embora tenham sido observados alguns casos de claudicação em cães geriátricos. A análise SWOT corroborou esta apreciação globalmente positiva, permitindo, contudo, identificar aspetos passíveis de melhoria, como a predominância de alojamento individual, o potencial impacto do piso em terra e da acumulação sazonal de lama no conforto de alguns animais, bem como a necessidade de monitorizar o efeito do contacto visual permanente entre cães. Com os resultados obtidos pode-se afirmar que o santuário apresenta, um contexto globalmente favorável ao bem-estar dos cães, mas também tendo ainda alguma margem para melhorar através de medidas práticas de maneio, enriquecimento ambiental e adaptação das infraestruturas.
- Computer vision tools to detect the precursors of tail biting in pigs: first steps towards methodological frameworkPublication . Paula, Ana Margarida Gomes Farinha; Oliveira, Jorge; Kasper, Claudia; Nasser, HassanAbstract: Tail biting is one of the most significant problems affecting production in terms of animal welfare, productivity, and health. In response, this project presents the application of existing computer vision and machine learning tools to detect the precursors of tail biting in pigs under field conditions. Computer vision systems can facilitate phenotyping to select more stress-resistant pigs and help detect problems at an early stage, both at the individual and group levels. Behavioural changes, such as activity in the pen, frequency of contact between pigs in a group, or handling of objects, can be indicative of the development of tail biting, among other problems. The proposed work curated an animal identification dataset that will support the creation of a reference database for detecting these changes. The data included approximately 1.800 h of video recordings of he daily lives of two groups of 12 fattening pigs, each weighing 100-140 kg, at Agroscope's experimental station in Switzerland. A bibliographical survey of existing computer vision systems for pigs allowed for the selection of the annotation and training tools and the development of an ethogram that was best suited to the project. From the initial set of images, we obtainde a first dat subset of 2,500 images automatically selected using Lightly for annotation. The annotation algorithm chosen was CVAT (Computer Vision Tool), which enabled 280 images to be annotated with bounding bozes and 520 with semi-automatic segmentation using the Segment Anything Model (SAM) for the classes of objects present in each image (ID of each pig, head, tail), location, and additional attributes, such as poses (lying down, standing, or sitting/keeling). The 280 images annoted with bounding bozes were use to train YOLOVv8, achieving and accuracy of 0.93 for the heads and 0.84 for the tail of the pigs. Although we did not achieve the desired accuracy, the results were quite satisfactory, given the number of frames for training. Althoug we could not train the object detection model with the images annoted with the Segment Anything Model within the allocated project time, we expect such an effort to yield better results, as the annotation is more accurate and provides greater amounts of ground truth, hence better accuracy.
- Integrated Soil Management: Food Supply, Environmental Impacts, and Socioeconomic FunctionsPublication . Pereira, José Luís da Silva; Pereira Domingues Martinho, Vítor JoãoThis Editorial refers to the Special Issue “Integrated Soil Management: Food Supply, Environmental Impacts, and Socioeconomic Functions”. The Special Issue highlights bringing a broader perspective on soil management, namely in its relationship with food supply, environmental dimensions, and socioeconomic activities. From a total of twenty-six manuscripts submitted for consideration and peer review, fourteen were accepted for publication and inclusion in this Special Issue (two reviews and twelve articles). The published contributions are listed below followed by a description review to encourage the reader to explore them.
- A prevalência de fungos no canal auditivo externo de cães com otite externaPublication . Parreira, Inês Batista; Esteves , Fernando; Vala, HelenaA otite externa é uma doença dermatológica que se caracteriza pela inflamação da orelha externa, incluindo o pavilhão auricular até à parede externa da membrana timpânica. A microbiota do canal auditivo externo é constituída por bactérias, como Staphylococcus spp. e fungos como ‘Malassezia pachydermatis’. Esta levedura pode manter a patologia mesmo após a erradicação do fator subjacente e ainda originar alterações patológicas permanentes no canal auditivo. Fatores como a produção excessiva de cerúmen, humidade excessiva e rutura da barreira epidérmica favorecem a multiplicação desta levedura. Os sinais clínicos, quando o agente da infeção é a ‘M. pachydermatis’, são uma coloração castanho-escura, húmida e com mau odor. O diagnostico de otite externa causada por ‘Malassezia pachydermatis’ baseia-se na observação de lesões compatíveis, na resposta a terapêutica antifúngica e na presença elevada de leveduras por observação direta no microscópio. Assim, o principal objetivo deste trabalho é determinar a prevalência de ‘Malassezia pachydermatis’ em cães diagnosticados com otite externa entre 1 de agosto de 2025 e 2 de fevereiro de 2026 na Clínica Veterinária de Vodskov, Dinamarca. Neste estudo foram incluí dos 65 cães que apresentavam sinais clínicos compatíveis com otite externa, dos quais 38,5% foram identificados como positivos ê 61,5% foram identificados como negativos. E ainda se demonstrou que a raça Labrador Retriever foi a raça com maior percentagem de casos positivos para Malassezia.